《暗影之王》的故事框架与《恶魔城》系列紧密相关，但又尽量避免讲述《恶魔城》的主线剧情。为此，可以说是一部仅在人物设定上与《恶魔城》一致的平行宇宙作品。《暗影之王2》 延续了《暗影之王》的故事线，但是穿插了作品《宿命镜面》，所以玩完1直接玩2的人会有点迷茫。至于《宿命镜面》的故事，则是关于教会对加百列的卑鄙欺骗。人们去打败德古拉，但特雷弗（儿子）失败了，变成了阿鲁卡多。西蒙（孙子）和阿鲁卡多联手击败了德古拉。德古拉陷入沉睡，命运之镜破碎。《暗影之王2》序言是从德古拉觉醒开始的故事，与DLC阿鲁卡多章节相连，主章与佐贝克的会面是后期剧情。

加百列击败被遗忘者后，对命运充满愤怒，成为最强暗影王——，邪龙德古拉。战十字也被他破坏掉，烧入时空牢狱的封闭空间之中。因为德古拉太强了，这是目前唯一能击败他的东西。本来时空监狱是绝对禁地，但进入这里对于可以穿越三界的佐贝克来说并不是问题，所以战十字被佐贝克修复；但战斗十字架在之前与卡米拉的战斗中被打破，碎片被阿鲁卡多回收并制成了吸血鬼杀手——真空剑。多年来，德古拉一直想向造成他不公平命运的上帝、佐贝克和撒旦报仇，但他没有办法找到他们，于是他主动“扮演”黑暗王子，在黑暗中作恶。事件发生，首先要镇压其他黑暗势力。首先，搅乱了局势，让三个“人”不得不现身，但明显被愤怒冲昏了头脑的德古拉却没有阿鲁卡多聪明，所以阿鲁卡多想到了一个更高效的方法。

Alucard认为他可以利用光之兄弟会的讨伐之机，用真空剑让Dracula假死。这样一来，撒旦在人间就不再有对手，并且带着统治三界的野心回来，他也无法战胜他。撒旦的佐贝克一定会想尽办法寻找德古拉活着的可能性，阻止撒旦的回归。真空剑的力量会让德古拉的记忆陷入支离破碎的阶段，让佐贝克既无法读心，也无法使用。巫术的目标是德古拉；而且他拥有可以让德古拉安息的战斗十字架，所以为了这个力量德古拉肯定会同意与佐贝克合作。所以Alucard打算让撒旦成功回归，然后让德古拉消灭他。

但破碎的记忆也会带来负面影响。和光之教团的三位创始人一样，德古拉的内心也有着污秽之血的黑暗。能压制他的只有加百列。健忘的力量让德古拉无法压制污秽之血，在正版中他开始表现得像个怪物，于是上帝派出了玛丽和阿鲁卡多来阻止污秽之血控制德古拉。所以本质上来说，《暗影之王2》是上帝利用阿鲁卡多的计划与德古拉联手清理人类世界的黑暗威胁，也就是说恶魔城进程中的玛丽和特雷弗都是“真实的”。